Το κιτ καθαρισμού RNA χρησιμοποιείται για τον καθαρισμό και την ανάκτηση μορίων RNA που μεταγράφονται in vitro και το ολικό RNA που εξάγονται από διάφορα υλικά, τα οποία μπορούν να απομακρύνουν αποτελεσματικά τις μολυσματικές ακαθαρσίες σε δείγματα RNA. Ο ρυθμός ανάκτησης αυτού του προϊόντος μπορεί να φθάσει το 80%και η αναλογία OD260/OD280 του ληφθέντος RNA είναι γενικά περίπου 2,0, η οποία μπορεί να χρησιμοποιηθεί άμεσα σε επακόλουθα ευαίσθητα πειράματα (όπως ανάλυση μικροσυστοιχίας, rt-PCR φθορισμού κ.λπ.). Με την εμβάθυνση της μεταγραφικής, η πολυπλοκότητα των τύπων RNA, η ρύθμιση της έκφρασης και οι λειτουργίες είναι πολύ πέρα από τη φαντασία μας.
Η αφαίρεση ριβοσωματικών RNA που αντιπροσωπεύουν περισσότερο από 80% βοηθά στην εστίαση της αλληλουχίας σε λιγότερο άφθονα αλλά ενημερωτικά RNAs. Επί του παρόντος, η απομάκρυνση του rRNA είναι κυρίως μέσω της συνδυασμένης χρήσης του ανιχνευτή και της RNase Η. Το επεξεργασμένο RNA θα αναμιχθεί με πολλά προϊόντα πέψης, ένζυμα και ιόντα, τα οποία δεν ευνοούν την επακόλουθη κατασκευή της βιβλιοθήκης RNA. Πάρτε το κιτ καθαρισμού RNA στη στήλη RNA ως παράδειγμα. Το Trizol είναι ένα έτοιμο προς χρήση αντιδραστήριο που μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τον καθαρισμό του ολικού RNA από τους ιστούς και τα κύτταρα. Πρόκειται για ένα απλό διάλυμα φαινόλης και ισοθειοκυανικής φαινόλης και γουανιδίνης που διευκολύνει τη λύση των ιστών και των κυττάρων, αναστέλλοντας τις RNases για τη διατήρηση της ακεραιότητας του RNA.